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病毒的表达方式
组成型表达:基因表达不受时期、部位、环境影响,没有时空特异性。CMV,UbiC,hEF1a等这一类启动子 特异型表达:启动子可以调控基因只能在一定的组织中才进行有效的表达。选用这样的启动子构建一系列组织特异性表达载体,如hSyn,gfaABC1D等 诱导型表达:有些基因表达极易受环境变化影响,在特定环境信号刺激下,有些诱导型表达载体指启动子必须在特殊的诱导条件下才有转录活性或比较高的转录活性的表达载体。外源基因处于这样的启动子下,必须在合适的诱导条件下才能表达。基因的表达方面为开放或增强,这种表达方式称为诱导表达。诱导型的体系,一般是通过一个小分子加到培养基,或者打到动物体内,目的基因的表达水平发生变化。这类载体有:pTight,pTRE 条件型表达:DIO,fDIO等 病毒扩散范围和血清型
扩散范围跟血清型关系比较大一些,2型最小,5型8型其次,9型最大。一般如果还没有包病毒,推荐给感染范围小的病毒。 如果病毒已经买了,那么目前能想的方法只有调整注射滴度和体积,一般相同颗粒数的病毒,如果采用高滴度小体积,会比低滴度大体积的感染范围小一些。 还有一种方法是:是用带Cre慢病毒跟DIO-AAV一起做,慢病毒因为体积大,扩散范围比AAV小,这样可以用慢病毒的感染范围限定AAV的感染范围,用这种方法还可以做稀疏标记。 FLEX和DIO是否可以联用
不同来源的FLEX序列其本身排列并不完全一致。是否能够使用还要看病毒来源,最重要的是看Lox序列排列。 2A和IRES的区别
这两种方法都被用来分隔两个蛋白,使它们能够被一个mRNA独立表达出来。 2A是一个短肽,大概20个氨基酸左右,表达时,将2A序列插入在两个蛋白序列中间,两个蛋白和2A序列在同一个阅读框中。当核糖体翻译到2A序列时,会断开多肽链并继续翻译下一个蛋白。2A因为其元件小,效率较高(>90%),前后蛋白表达水平接近(相差约2倍),可以多个串联(比如3个蛋白用两个2A连接)而广受欢迎。常用的2A序列有T2A,P2A等。不过2A翻译后,会在前一个蛋白C端留下约20个氨基酸,在后一个蛋白N端留下一个脯氨酸残基,可能会影响一些蛋白的功能。另一方面,有一些前面的蛋白会影响2A的切割效率,造成大部分蛋白无法分隔的现象。 IRES现在比较少用,主要是因为IRES后面的蛋白翻译效率不高,往往只有IERS前面一个蛋白的1/10,而且IRES元件比较大,约0.6kb。不过好处是两个蛋白序列上完全隔开,没有相互影响,比较干净,而且IRES前的基因表达水平一般是有保障的。 荧光和标签
荧光(较大):可定位目的蛋白,有EGFP,mCherry,mRuby,EYFP等 Tag(较短):可用于检测目的蛋白,比如通过Westernblot,有Flag,HA,V5等 载体容量
AAV单链:4.7kb AAV双链:2.35kb左右(单链容量除以2) LV:7kb,除去必需元件(2kb),大概可以插入5kb |